Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms