Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms