Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

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Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Nlrc3Q5DU56 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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