Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms