Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms