Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa20Q45VN2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms