Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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