Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms