Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms