Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms