Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Prdm6Q3UZD5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Prdm6Q3UZD5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Prdm6Q3UZD5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Prdm6Q3UZD5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Prdm6Q3UZD5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Prdm6Q3UZD5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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