Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm27235Q3UW50 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms