Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms