Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmod2Q3UHZ5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmod2Q3UHZ5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmod2Q3UHZ5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmod2Q3UHZ5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmod2Q3UHZ5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmod2Q3UHZ5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmod2Q3UHZ5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmod2Q3UHZ5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmod2Q3UHZ5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmod2Q3UHZ5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmod2Q3UHZ5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmod2Q3UHZ5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmod2Q3UHZ5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmod2Q3UHZ5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmod2Q3UHZ5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms