Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitpnm3Q3UHE1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms