Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Garem1Q3UFT3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms