Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms