Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms