Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk3Q3U3Q1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms