Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms