Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc136Q3TVA9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms