Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms