Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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