Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms