Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms