Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc69Q3TCJ8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms