Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms