Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam171bQ14CH0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam171bQ14CH0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam171bQ14CH0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam171bQ14CH0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam171bQ14CH0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam171bQ14CH0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam171bQ14CH0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam171bQ14CH0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam171bQ14CH0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam171bQ14CH0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam171bQ14CH0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam171bQ14CH0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam171bQ14CH0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam171bQ14CH0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam171bQ14CH0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam171bQ14CH0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam171bQ14CH0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam171bQ14CH0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam171bQ14CH0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam171bQ14CH0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam171bQ14CH0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam171bQ14CH0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms