Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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