Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
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Traf3ip1Q149C2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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