Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms