Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntnap5bQ0V8T8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms