Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms