Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnnm1Q0GA42 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms