Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms