Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MestQ07646 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MestQ07646 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MestQ07646 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MestQ07646 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MestQ07646 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MestQ07646 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MestQ07646 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MestQ07646 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MestQ07646 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MestQ07646 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MestQ07646 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MestQ07646 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MestQ07646 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MestQ07646 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MestQ07646 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MestQ07646 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MestQ07646 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MestQ07646 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MestQ07646 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MestQ07646 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MestQ07646 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MestQ07646 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MestQ07646 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MestQ07646 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MestQ07646 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MestQ07646 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MestQ07646 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MestQ07646 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MestQ07646 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MestQ07646 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MestQ07646 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MestQ07646 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MestQ07646 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MestQ07646 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MestQ07646 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MestQ07646 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MestQ07646 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms