Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms