Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms