Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms