Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms