Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms