Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms