Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms