Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms