Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms