Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms