Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms