Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoa1Q00623 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms