Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Npas1P97459 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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Npas1P97459 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Npas1P97459 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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