Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irx3P81067 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx3P81067 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx3P81067 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx3P81067 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx3P81067 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx3P81067 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms